Chủ phương tiện vi phạm quy định về vận chuyển người, hành khách; hành khách thì lảng tránh chấp hành quy tắc an toàn dễ khiến thêm nhiều nỗi lo về đường thủy nội địa.
Người sử dụng phương tiện không có động cơ sức chở đến 12 người để vận chuyển người, hành khách mà không bố trí chỗ ngồi, để hành khách đứng hoặc có hành vi khác làm mất an toàn, hoặc để người, hành khách ngồi trên mui hoặc hai bên mạn của ghe, thuyền, ca nô xuất hiện không phải là hiếm. Nhiều trường hợp xếp người, hành khách, hàng hóa, hành lý, xe đạp, mô tô, xe gắn máy… làm nghiêng lệch phương tiện hoặc che khuất tầm nhìn của người điều khiển. Chủ thuyền cũng không có nội quy an toàn hoặc không phổ biến nội quy an toàn, không hướng dẫn cách sử dụng thiết bị, dụng cụ an toàn; lại còn chở động vật nhỏ mà không nhốt trong lồng, cũi hoặc chở động vật lớn cùng với người, hành khách. Những hành vi kể trên rất nguy hiểm, bởi dễ khiến ghe, thuyền mất thăng bằng dẫn đến bị lật. Nguy cơ thương vong là rất cao, trong điều kiện sông nước mênh mông, lại thiếu lực lượng ứng cứu và khó kịp thời như trên đường bộ. Ngoài mất an toàn, hành vi này của người sử dụng phương tiện sẽ bị phạt cảnh cáo hoặc phạt tiền từ 100 - 200 nghìn đồng.
Người sử dụng phương tiện không có động cơ sức chở trên 12 người, phương tiện có động cơ sức chở đến 12 người để vận chuyển người, hành khách nếu có một trong các hành vi đón, trả hành khách không đúng nơi quy định; không có danh sách hành khách trong mỗi chuyến hoặc có danh sách hành khách nhưng không đúng quy định, trừ vận chuyển hành khách ngang sông; xếp hàng hóa, hành lý trên lối đi của hành khách sẽ bị phạt tiền từ 200 - 300 nghìn đồng. Người sử dụng phương tiện tốc độ cao để vận chuyển hành khách chạy không đúng tuyến, trừ vận chuyển hành khách theo hợp đồng; bỏ chuyến đã đăng ký; chuyển nhượng hành khách sang phương tiện khác khi chưa được sự đồng ý của hành khách bị phạt tiền 500 - 700 nghìn đồng đối với tốc độ thiết kế từ 30km/h trở lên có sức chở dưới 5 người; 700 nghìn đồng đến 1 triệu đồng đối với tốc độ thiết kế từ 30km/h trở lên có sức chở từ 5 người đến 12 người…
Hành vi chở vượt quá sức chở người của phương tiện vận tải hành khách ngang sông sẽ bị phạt tiền 50 nghìn đồng trên mỗi người chở vượt quá số người được phép chở, nếu chở vượt từ 5% đến 20% số người được phép chở; 70 nghìn đồng trên mỗi người chở vượt quá số người được phép chở, nếu chở vượt trên 20% đến 50% số người được phép chở; phạt tiền 100 nghìn đồng trên mỗi người chở vượt quá số người được phép chở, nếu chở vượt trên 50% số người được phép chở. Ngược lại, hành khách bị phạt cảnh cáo hoặc phạt tiền từ 50 - 100 nghìn đồng nếu không chấp hành nội quy an toàn trên phương tiện, không chấp hành sự hướng dẫn của thuyền viên, người lái phương tiện; 100 - 200 nghìn đồng nếu không mặc áo phao cứu sinh hoặc không mang dụng cụ nổi cứu sinh khi tham gia giao thông trên phương tiện vận tải hành khách ngang sông. Nếu mang hành lý thuộc loại hàng hóa mà pháp luật cấm vận tải chung với hành khách; gây mất trật tự, an toàn thì bị phạt tiền từ 200 - 500 nghìn đồng.